据《The EDGE Financial Daily》、《南洋商报》11月7日报道，台湾交通部门指出采用日本新干线系统的台湾高铁截至今年6月，累计亏损470亿台币，目前存在533亿台币资金缺口，如无法解决当前财务困难，或将于明年3月破产。

　　台湾高铁采用建设-运营-移交的BOT模式，台湾高铁公司（THSRC）于1997年以较低的竞标价格和无需政府资金的承诺获得该高铁项目，但1998年受东南亚金融危机冲击，THSRC即陷入资金困难，只好低调向台国营公司筹借资金，项目面临高昂的银行利息和折旧成本。2008年，项目运营再次受到次贷危机影响，直至2009年，台湾政府通过高价赎买并提高票价，该项目才开始止损。

　　马媒体分析马新高铁项目应从台湾高铁项目吸取教训，一是即使经济状况良好，对于特大型建设项目而言，私人融资成本将远高于政府资金；二是THSRC曾违背与欧洲列车集团（Eurotrain）达成的采用欧洲系统的承诺而转用日本新干线，陷入法律纠纷，据称当时台湾方面主要出于政治考虑做出决定。??