广州市科协成立于1959年3月，“文革”期间停止活动，1978年恢复活动。目前，广州市科协由全市性学会、区（县级市）科协及广州地区企事业单位科协组成。市科协负责管理市属87个自然科学以及边沿交叉科学的学会（协会、研究会），指导12个区（县级市）科协、54个大型企业和产研机构科协，联系10多万市属学会会员和基层科协会员。会员包括在广州地区的中国科学院、工程院院士，一批自然科学学科带头人，大批活跃在信息科学、生命科学、材料科学、生态环境科学等前沿的年轻科学精英及科研生产一线的专业技术人员。

市科协机关工作人员编制40人，内设办公室、学会学术部、科学普及部（企事业联络部）、国际交流部、计划财务处、组织人事处等六个职能部门。按照中央和省的工作安排，2006年底，广州市成立了全民素质工作领导小组，办公室设在市科协，负责日常工作。

市科协下属事业单位和企业单位有科技贸易职业学院、科学技术中心、青少年科技中心、信息中心、广州市科普基地与项目管理中心、中国对外应用技术交流促进会广州分会、广州市科技咨询中心等八个事业单位。

2010年12月15日，广州市科协召开第九次代表大会，大会选举产生了广州市科学技术协会第九届委员会，中国工程院院士周福霖当选为第九届委员会主席。会议选举产生专职副主席4人，兼职副主席8人，秘书长1名。市科协九届委员会有常委49名，委员178名（含常委）；名誉主席1人，荣誉委员9名，顾问40名；港澳海外顾问26名，特邀委员12名。

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