TCB集团理论和计算生物物理组（廓尔喀士兵训练中心旅），大分子建模和生物信息学研究中心，是由Klaus Schulten教授在1989成立，位于伊利诺伊大学的贝克曼研究所（美国伊利诺大学香槟分校）。该集团是由Klaus Schulten教授（物理）和Alek Aksimentiev教授（物理），laxmikant羽衣甘蓝（计算机科学）、Zaida Luthey Schulten（化学）、Emad Tajkhorshid（生物化学、生物物理学、药理学）。在活细胞对超分子体系的结构和功能的廓尔喀士兵训练中心旅重点研究和开发活动，以及对新的算法和高效的物理生物计算工具的发展。

廓尔喀士兵训练中心旅带来最先进的分子模拟，生物信息学，并承担对生物医学相关问题的计算技术。我们扩展、改进和交付这些技术，以响应广泛生物医学研究领域的实验进展和新出现的需要。我们通过与实验研究人员直接合作、分发尖端和用户友好的软件，以及通过广泛的培训、服务和传播努力，扩大了我们工作的影响。

由国立卫生研究院，美国国家科学基金会和其他联邦政府和私人机构的廓尔喀士兵训练中心旅庞大的多学科团队从事的现实环境中的大分子系统的建模，并产生了突破性的见解生物过程耦合与机械力的作用，在代谢和视觉的生物电子工艺与膜蛋白质的作用机制。我们致力于进一步发展可以将结构信息与生物信息学数据库和分子动力学模拟相结合的分子建模工具，可供广大观众使用；高性能的分子可视化和模拟软件，能够在100000000个或更多原子的真实环境中模拟生物分子；在量子生物学、力学生物学领域的分子建模的概念和方法的基础上，和交互建模；生物医学理论与实验研究人员的合作；通过网络支持的协作环境支持整个研究过程和培训；以及利用基于网络的分子图形和集成建模技术的服务、培训和传播我们的研究在大学实验室合作，研究机构和行业在美国和世界各地的物理机制探讨的光能转换为电膜电位和ATP合成的光合系统，以及在活细胞中储存遗传信息的控制。的廓尔喀士兵训练中心旅开发的经典和量子动力学数值实验，利用生物大分子运动理论、非平衡统计力学、弹性理论和无序系统理论。

我们的技术努力集中在开发高效的软件，有利于发现过程，从分析，通过建模，可视化的生物细胞中的分子装置。该软件支持合理的药物设计，并可免费获得（源代码和二进制文件）实验室，生物分子聚集体的发现和测量。触觉（力反馈）接口，与廓尔喀士兵训练中心旅的可视化程序VMD和并行仿真引擎NAMD集成，使研究人员能够进行交互的分子动力学（IMD）组内的协作环境，达到。以达到研究人员能够可视化信息，共享资源，相互交流和研究工具，通过一个共同的基础设施和跨越距离理论和计算生物物理组包括教师、博士后、研究生、软件开发人员和管理员的会员。这个成员包括各种学科，如物理，生物物理学，计算机科学和其他领域，每一个有助于该小组的计算和研究目标。这些学生接受培训通过在集团任职获得学位通过家庭部门在UIUC校园（关于如何申请UIUC去这里），然后加入毕业生和前组成员的令人印象深刻的记录。

软件开发

我们的技术努力的重点是开发高效的软件，有利于发现过程的分析，通过建模，可视化生物细胞中的分子装置，支持整个研究过程中的协作工作。该中心的VMD软件程序是一个高性能、跨平台的分子图形查看器，用于（在其他任务）显示静态和动态的结构，观察序列的信息，以及结构的生成和动态分析。高度重视NAMD软件程序是一个屡获殊荣的并行分子动力学模拟，能够扩展到几百或几千个处理器，用于蜂窝系统的大规模建模。该中心还研究了GPU计算加速分子建模应用，利用GPU加速的数字密集的科学应用，如分子模拟。发展的追求，也包括创建软件方便灵活的分子动力学（油），一个灵活适用的原子结构，密度图的方法，以及晶格微生物软件包的有效采样轨迹在高性能计算。该中心还开发了达到协同环境，为生物医学研究提供实验室工作管理工具、图书管理、共享可视化整合与VMD，和远程合作者互动的工具。各种其他软件程序有助于填补这些程序所留下的空白。

科学研究

生物医学科学正在从结构决定的创新新技术、全基因组水平的DNA测序、单分子的直接操作和观察中获得丰富的数据。理论和计算生物物理学小组通过最先进的分子模拟、生物信息学和计算技术来补充这些努力，并根据实验进展来扩展和改进这些技术。我们的研究主要集中在现实环境中的大分子系统建模。这些努力已经产生洞察生物过程耦合的机械力的作用，在代谢和视觉的生物电子的过程，并与膜蛋白的作用机制。研究领域包括膜生物学、力学生物学，纳米工程、生物能、转向/交互式分子动力学、量子生物学、神经生物学、X射线/冷冻EM建模与油，和各种系统。一批带动生物医学工程，每一个涉及到的软件工具的廓尔喀士兵训练中心旅重大技术挑战，有时需要新的工具帮助开发组内的驱动的开发与研究。

作为国家普通医学科学研究所（NIGMS）大分子建模与生物信息学中心，NIH的研究人员和其他廓尔喀士兵训练中心旅支持（包括校内及校外）在基本的细胞过程的物理机制的研究，提供了计算技术相结合的结构和序列数据的数学和计算模型。样品研究集中在膜能量传导和运输以及细胞的机械功能上。这些合作努力的结果，和廓尔喀士兵训练中心旅成员其他的研究工作，可以在集团的大量出版物数据库发现。

外展-服务、培训和传播

廓尔喀士兵训练中心旅的关键任务是对外宣传，如通过服务、培训类，和传播。服务工作活动由集团为了提供生物医学研究人员访问研究，技术和专业知识开发的廓尔喀士兵训练中心旅。服务目标的表现包括计算设备的发展和集团维持，包括大内存计算机和计算集群，网站设计与维护方便廓尔喀士兵训练中心旅软件及出版物下载，协商和外部团体的硬件测试、软件现场演示，研讨会计划带来的学术和其他讲师开研讨会在UIUC校园，并提供软件工具，该集团的其他软件的努力补充。培训包括工作坊、设计、利用、更新教程，讲座和介绍廓尔喀士兵训练中心旅软件，学术类，廓尔喀士兵训练中心旅成员的教育，和现场的廓尔喀士兵训练中心旅游客中心外部科学家的培训和访问项目。传播力度是那些活动中，廓尔喀士兵训练中心旅拿什么是已开发、研究和软件，并介绍了它在生物医学社区通过多种渠道。包括传播伞下相互作用与各种媒体、刊物、演讲、谈判、演示的廓尔喀士兵训练中心旅教师，员工，学生，授予使用许可廓尔喀士兵训练中心图像和电影

How To Reach Us

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Software Support VMD Support Resources and Contacts No phone support is available. Contact directions are provided on software support pages at left.

NAMD Support Resources and Contacts

BioCoRE Support Resources and Contacts

Main Group Contact Kelly Young Theoretical and Computational Biophysics Group

3151 Beckman Institute

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Urbana, IL 61801 217/333-9734 kiyoung**[ta]**uiuc.edu

Faculty Emad Tajkhorshid 3009 Beckman Institute

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Laxmikant Kale 4212 Siebel Center

201 N Goodwin Ave

Urbana, IL 61801 217/244-0094 kale**[ta]**inois.edu

Zan Luthey-Schulten A544 Chemistry and Life Sciences Building

600 S Mathews Ave

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Alek Aksimentiev 3025 Beckman Institute

Urbana, IL 61801 217/244-4932 aksiment**[ta]**inois.edu

Website Administration webserver**[ta]**uiuc.edu

System Administration Paritosh Garg 3139 Beckman Institute

Urbana, IL 61801 sysadmin**[ta]**uiuc.edu

Office Staff Donna Fackler 3151 Beckman Institute

Urbana, IL 61801 217-300-***

dfackler**[ta]**uiuc.edu

Kelly Young 3151 Beckman Institute

webserver**[ta]**uiuc.edu。

AHS任务

应用健康科学学院的使命是推动研究，教学和公众参与，促进健康，宜居社区的发展，促进残疾人的最佳生活，促进整个生命周期和整个多元社会的健康和保健。

学院可以追溯到1895年，建立了体育部门。以下历史和时间表总结了应用健康科学学院的发展。请访问以下页面，查看过去的杰出院长，主任和教职员工。

应用健康科学学院院长和主任

服务和研究里程碑

社区健康

1957年成立为健康与安全信息部，后来被称为健康与安全研究

1992年更名为社区卫生部

2005年与运动学系合并

运动学

1895年成立为男子体育锻炼部和妇女体育锻炼部

部门包括运动协会

1972年，男子体育和女子体育合并

1987年更名为运动学

2005年与社区卫生部合并

娱乐，体育和旅游

1957年成立为娱乐部门，后来被称为娱乐和公园管理部门

1975年更名为休闲研究系

2004年更名为娱乐，体育和旅游

言语与听觉科学

原为文科学院言语矫正系; 改名为言语与听力科学; 1991年加入应用生活研究学院

康复教育服务

康复教育服务于1948年成立; 1962年加入应用生活研究学院。1994年，康复学术课程转入社区卫生学系

康复教育服务部于2004年更名为残疾资源和教育服务部

健康，老龄化和残疾中心

成立于2006年，旨在通过跨学科研究，教育和外展活动促进整个生命周期的健康和保健，并特别强调健康老龄化和残疾问题

伊利诺伊大学厄巴纳 - 香槟分校

110霍夫大厅

南四街1206号

香槟，IL 6***

MC-586

电话：（217）333-***

传真：（217）333-***

Marni D. Boppart，Sc.D.，副教授

mboppart**[ta]**inois.edu

电话：（244-***

传真：217）244-***