哥斯达黎加的关税税率自2001年以来基本保持不变，2007年的平均保护税率为5.9%，其中农产品为13.4%，其他产品为4.7%；适用税率以加权平均值来看已降至3.9%，但在实际操作中更低，因为计算的依据只是最惠国税率，并未将优惠协议下的适用税率计算在内。绝大多数商品的税率在0-15%之间，其中约一半的税率为0-1%。2007年，60.7%的商品适用税率在0-5%之间，16.7%在5-10%之间，21.1%在10-15%之间。

　　此外，无论是国产商品还是进口商品，哥斯达黎加均征收下列内部税：

　　（1）普通销售税（IGV，税率一般为13%）；

　　（2）选择消费税（ISC）；

　　（3）对酒精和非酒精饮料、卫浴香皂等征收特别税；

　　（4）市政发展促进税（IFAM）；

　　（5）耕种发展税（IDA）。

　　下列商品免征IGV：

　　（1）基本食品；

　　（2） 农机的轮胎；

　　（3）兽药及兽医医疗设备；

　　（4）农用设备和农药等；

　　（5）医药；

　　（6）煤油；

　　（7）渔业用柴油；

　　（8）书籍；

　　（9）音乐作品；

　　（10）本国产画作；

　　（11）棺材；

　　（12）出口商品及出口后3年内再进口的哥斯达黎加商品也免征IGV。

　　ISC的征收对象是：啤酒，葡萄酒及其他发酵型饮料；混合型发酵饮料；酒精含量低于80%的威士忌；白酒、烈酒及其他烈性饮料；雪茄、香烟和其他烟草；国产电器；汽车；乳香；涂料；化妆品；美发产品。

　　IFAM的征收对象是：烈酒、蒸馏饮料和其他烈性饮料。IDA的征收对象是：香烟、烈酒、蒸馏饮料和烈性饮料、啤酒、软饮料、碳酸饮料。